Der Name „Bakerzyste“ geht auf den englischen Chirurgen William Morrant Baker (1839-1896) zurück. Als Bakerzysten werden flüssigkeitsgefüllte Hohlräume im Bereich der Kniekehle bezeichnet.
Diese sind im Regelfall Folge von Gelenkergüssen im Kniegelenk. Durch den Druck im Gelenk kommt es zu einer Ausstülpung der dorsalen Gelenkkapsel zwischen dem Musculus gastrocnemius und dem Musculus semimembranosus. Hier findet sich eine Stelle, an der die Gelenkkapsel nicht so „stabil“ wie an anderen Stellen ist und an der sich aufgrund des Druckes Kapselanteile nach hinten vorwölben können (Locus minoris resistentiae).
Ursache der Gelenkergüsse können Schäden im Bereich des Kniegelenkes sein wie z.B. Meniskusrisse oder Knorpelschäden.

Da die Bakerzyste nicht die Ursache, sondern die Folge des Problemes ist, ist die operative Entfernung der Bakerzyste selten sinnvoll.
Um die Ursache des Problemes zu beseitigen, muss die Ursache der Gelenkergüsse adressiert werden.
Ist der den Gelenkerguss verursachende Schaden im Kniegelenk behoben (z.B. durch eine arthroskopische Meniskusteilresektion/-naht), kommt es im Regelfall zu einer Rückbildung der Bakerzyste.
Eine Punktion der Bakerzyste ohne Beseitung der Ursache führt im Regelfall nur zu einer zeitlich begrenzten Linderung der Beschwerden.

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